آفتاب خرد بر این باور است که فهم ریشه‌ها، تحولات و شکافهای گفتمانی موجود در جامعه ایرانی، نیازمند نگاهی نظام‌مند، تاریخی، تطبیقی و میان‌ رشته‌ای است. از همین رو، جریان شناسی فکری و فرهنگی ایران معاصر یکی از محورهای بنیادین فعالیت این مؤسسه تلقی می شود.